Dostawa sekwenatora DNA nowej generacji wraz z wyposażeniem do Katedry Diagnostyki i Patofizjologii Roślin Wydziału Kształtowania Środowiska i Rolnictwa Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego w Olsztynie
Sekwenator DNA nowej generacji wraz z wyposażeniem w skład którego wchodzi termocykler do analiz QPCR, stacja dozująca oraz homogenizator.
Sekwenator DNA nowej generacji.
Sekwenator powinien stanowić system detekcyjny oparty o działanie kamery CCD do analizy znaczników fluorescencyjnych. Pojedyncze odczyty sekwencji o długości minimum 500 nukleotydów. Możliwość maksymalnie 100 tysięcy odczytów w trakcie jednej reakcji sekwencjonowania o dokładności pojedynczego odczytu nie mniej niż 99,5 procent na fragmencie 400 nukleotydów. Dokładność złożonej sekwencji powinna wynosić nie mniej niż 99,99 procent. System powinien być wyposażony w komputer wraz monitorem. Do aparatu powinny być dołączone odczynniki systemowe (33 zestawy w sukcesywnych dostawach). Możliwość przeprowadzania reakcji i analizy wyników sekwencjonowania z użyciem dołączonego do systemu komputera wraz z brakiem konieczności stosowania serwerów.
Termocykler do analiz QPCR.
Urządzenie umożliwiające przeprowadzanie ilościowej reakcji PCR w czasie rzeczywistym z użyciem barwników fluorescencyjnych do jednoczesnej amplifikacji 96 prób. Zakres objętości mieszany reakcyjnej, w której można przeprowadzić reakcję PCR: 10 – 100μl. Prędkość nagrzewania bloku do 4,4 stopni C/sek (dla bloku 96-dołkowego). Prędkość chłodzenia bloku do 2,2 stopni C/sek (dla bloku 96-dołkowego). Urządzenie dodatkowo powinno być wyposażone w blok 384. Materiał z jakiego wykonany jest blok: srebro. Zakres temperatur bloku: 37 – 95 stopni C. Homogenność termiczna bloku: plus/minus 0,4stopni C w ciągu 60 sekund od momentu osiągnięcia temperatury docelowej (72 stopnie C). Dokładność termiczna bloku: plus/minus 0,3 stopnie C w ciągu 10 sekund od momentu osiągnięcia temperatury docelowej (55 – 95 stopni C) oraz plus/minus 0,2 stopni C w ciągu 60 sekund od momentu osiągnięcia temperatury docelowej (55 – 95 stopni C). System detekcyjny – kamera CCD wysokiej czułości. 5 kanałów wzbudzenia światła. 6 kanałów detekcji fluorescencji. Element wzbudzający – lampa ksenonowa. Możliwość samodzielnej wymiany źródła światła (żarówka) przez użytkownika, bez potrzeby wzywania serwisu firmy do laboratorium. System otwarty, umożliwiający analizę kwasów nukleinowych przy pomocy różnych barwników i sond molekularnych: SYBR Green I, Barwnik interkalujący typu LC Green (lub podobny) do analizy HRM (High Resolution Melting), Sonda hydrolizująca typu TaqMan. Sonda Hybrydyzująca typu HybProbe. Sonda Simple Probe. Oprogramowanie urządzenia umożliwia wykonanie pomiaru ilości kopii DNA w badanej próbie, pomiaru poziomu ekspresji genu badanego w stosunku do genu referencyjnego, analizy genotypowania – analiza genotypu na podstawie temperatury topnienia produktu, analizy Gene Scanning/High Resolution Melting służąca do analizy mutacji (w tym SNP) przy pomocy specjalnego barwnika interkalującego typu LC Green lub podobny, analizy end-point mutation, porównania płytek z wynikami dla wszystkich dostępnych aplikacji z uzyskaniem wyniku w oprogramowaniu typu MS Excel. Możliwość wykonania analizy Gene Scanning/High Resolution Melting bez konieczności wprowadzania standardów o znanym genotypie; poszczególne krzywe mogą być łączone w grupy automatycznie, na podstawie swojego podobieństwa.
Wyposażenie aparatu: komputer typu laptop do sterowania aparatem i analizy danych i drukarka kompatybilna z zaoferowanym komputerem.
Instrukcja w pełnej wersji w języku polskim oraz angielskim.
Oprogramowanie aparatu i baza danych z opcją automatycznego zapisywania informacji o wszystkich zmianach w plikach z otrzymanymi wynikami dokonywanych przez użytkowników aparatu.
Możliwość utworzenia pliku z podsumowaniem reakcji PCR (m.in. parametry reakcji PCR, wyniki, wykresy) w formacie .pdf.
Stacja dozująca.
Automatyczna stacja pipetująca, powinna pozwalać na pracę z wykorzystaniem minimum 4 miejsc, w których mogą znajdować się płytki, probówki w statywach oraz końcówki dla głowic dozujących. Powinna posiadać dodatkowe miejsce na pojemnik na zużyte końcówki. Możliwość pracy z płytkami 24, 48, 96 i 384 dołkowymi oraz probówkami 0,5, 1,5, 2,0 oraz 0,2 ml. Możliwość zakresu dozowania co najmniej 1-1 000 ul. Możliwość stosowania głowic dozujących jedno i ośmiokanałowych w co najmniej trzech zakresach zachodzących na siebie. Narzędzia dozujące oraz akcesoria autoklawowalne odporne na temp. 121 stopni C. Powinna posiadać bezdotykowy czujnik optyczny rozpoznający: poziom cieczy, rodzaj akcesoriów i typ końcówek pozwalający na dozowanie bez potrzeby zanurzania końcówek w roztworze do którego odbywa się dozowanie (dla ochrony przed kontaminacją). Stacja powinna mieć możliwość wyposażenia w głowice 1 i 8-kanałowe w trzech zachodzących na siebie zakresach objętościach (1–50 ul, 20-300 ul lub 40-1 000 u). Powinna posiadać 7-pozycyjnych uchwytów na zasobniki do odczynników. Powinna posiadać 24 miejscowy termoblok do probówek o objętości 1,5ml, 2,0ml oraz termoblok dla płytek 96 i 384 probówek 0,2 ml.
Homogenizator.
Homogenizator powinien być systemem do mechanicznej homogenizacji o przepustowości 24 próbek jednocześnie umieszczonych w 2 ml probówkach. Powinien posiadać możliwość wyboru specyficznie wyselekcjonowanego złoża dedykowanego odpowiedniemu typowi próbki, gwarantującego optymalny proces dezintegracji próbek przy zachowaniu wysokiej jakości ekstrahowanego materiału, spośród takich jak piasek granatu i kulka ceramiczna dedykowana do dezintegracji wszelkiego rodzaju próbek w celu późniejszej izolacji DNA. Możliwość zastosowania kulek krzemionkowych o średnicy 1 mm do dezintegracji drożdży i grzybów oraz kulek ceramicznych o średnicy 1.4 mm do dezintegracji materiału zwierzęcego lub roślinnego w celu późniejszej izolacji RNA oraz kompozycji kulek ceramicznych o średnicy 1.4 mm i kulek krzemionkowych o średnicy 0.1 mm oraz kulek szklanych o średnicy 4mm do dezintegracji wszelkiego rodzaju próbek pobranych ze środowiska. Powinien posiadać możliwość rozbudowy o moduły 24 x 2 ml, 48 x 2 ml, 24 x 4,5 ml, 12 x 15 ml, 2 x 50 ml oraz prowadzenie procesu dezintegracji w bloku chłodzącym dla objętości: 2 ml, 15 ml i 50 ml.
Homogenizator powinien posiadać następujące parametry techniczne:
Programowalna prędkość i czas cyklu pracy, możliwość zapamiętania dowolnych 5 programów (kombinacji prędkości i czasu), aluminiowy talerz obrotowy, wymienne polipropylenowe ramię przytrzymujące próbki oraz polipropylenowa rynienka. Obie części powinny być ruchome i zezwalać na łatwość utrzymania urządzenia w czystości oraz natychmiastową, skuteczną dekontaminację w przypadku kontaktu z materiałem niebezpiecznym dla życia lub zdrowia. Powierzchnie powinny być odporne na chemikalia. Wymagany czas pracy: zakres: 1–60 sec z przyrostem co 1 sec, prędkość: zakres: 4.0–6.5 m/sec z przyrostem co 0.5 m/sec, przyspieszenie: < 2 sec do maksymalnej prędkości, opóźnienie: < 2 sec do momentu zatrzymania, poziom hałasu: <70 db, zakres temperatury pracy urządzenia: 15 do 35 stopni C.
Termin
Termin składania ofert wynosił 2012-06-21.
Zamówienie zostało opublikowane na stronie 2012-05-08.
Kto?
Co?
Historia zamówień
| Data |
Dokument |
| 2012-05-08
|
Ogłoszenie o zamówieniu
|
| 2012-05-25
|
Dodatkowe informacje
|