Usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing)

Narodowy Instytut Leków

1. Przedmiotem niniejszego zamówienia jest usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing). 2. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach). 3. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek 4. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA: • całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore) • stężenie w próbce >100 ng/ul • czystość (A260/A280) ≥ 1.8 5. Za prawidłowe wykonanie usługi uważa się: • sprawdzenie jakości próbek DNA dostarczonych przez Zamawiającego • sekwencjonowanie nowej generacji NGS przygotowanych preparatów prób bakteryjnego DNA z zapewnieniem wymaganej ilości odczytów (pokrycie min. 50x) • sekwencjonowanie trzeciej generacji NGS przygotowanych preparatów dla wybranych prób bakteryjnego DNA • wykonanie analizy bioinformatycznej i przekazanie danych Zamawiającemu wraz z raportem końcowym. • w trakcie wykonywania usługi bieżące informowanie Zamawiającego o postępach prac nad zleconymi próbkami i ew. problemach, np. w zakresie jakości przesłanych próbek DNA, poprzez kontakt mailowy 6. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zawiera SWZ oraz Opis przedmiotu zamówienia - Załącznik nr1, Projektowane postanowienia umowy - Załącznik nr 2, Formularz cenowy - Załącznik nr 5. 7. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert częściowych. 8. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert wariantowych. 9. Zamawiający nie przewiduje skorzystania z prawa opcji. 10. Zamawiający nie przewiduje zawarcia umowy ramowej.

Termin

Termin składania ofert wynosił 2024-11-28. Zamówienie zostało opublikowane na stronie 2024-10-23.

Dostawcy

Następujący dostawcy są wymienieni w decyzjach o przyznaniu zamówienia lub innych dokumentach dotyczących zamówień:

Kto? Co? Gdzie?
Historia zamówień
Data Dokument
2024-10-23 Ogłoszenie o zamówieniu
2025-01-07 Ogłoszenie o udzieleniu zamówienia
Ogłoszenie o zamówieniu (2024-10-23)
Obiekt
Zakres zamówienia
Tytuł: Usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing)
Numer referencyjny: 20/NIL/ZZ-SP/24
Krótki opis:
1. Przedmiotem niniejszego zamówienia jest usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing). 2. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach). 3. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek 4. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA: • całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore) • stężenie w próbce >100 ng/ul • czystość (A260/A280) ≥ 1.8 5. Za prawidłowe wykonanie usługi uważa się: • sprawdzenie jakości próbek DNA dostarczonych przez Zamawiającego • sekwencjonowanie nowej generacji NGS przygotowanych preparatów prób bakteryjnego DNA z zapewnieniem wymaganej ilości odczytów (pokrycie min. 50x) • sekwencjonowanie trzeciej generacji NGS przygotowanych preparatów dla wybranych prób bakteryjnego DNA • wykonanie analizy bioinformatycznej i przekazanie danych Zamawiającemu wraz z raportem końcowym. • w trakcie wykonywania usługi bieżące informowanie Zamawiającego o postępach prac nad zleconymi próbkami i ew. problemach, np. w zakresie jakości przesłanych próbek DNA, poprzez kontakt mailowy 6. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zawiera SWZ oraz Opis przedmiotu zamówienia - Załącznik nr1, Projektowane postanowienia umowy - Załącznik nr 2, Formularz cenowy - Załącznik nr 5. 7. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert częściowych. 8. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert wariantowych. 9. Zamawiający nie przewiduje skorzystania z prawa opcji. 10. Zamawiający nie przewiduje zawarcia umowy ramowej.
Pokaż więcej
Rodzaj umowy: Usługi
Produkty/usługi: Laboratoryjne usługi badawcze 📦
Opis
Wewnętrzny identyfikator: 20/NIL/ZZ-SP/24
Opis zamówienia:
1.Przedmiotem zamówienia jest usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing). 2. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach). 3. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek 4. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA: • całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore) • stężenie w próbce >100 ng/ul • czystość (A260/A280) ≥ 1.8. 5. Za prawidłowe wykonanie usługi uważa się: • sprawdzenie jakości próbek DNA dostarczonych przez Zamawiającego • sekwencjonowanie nowej generacji NGS przygotowanych preparatów prób bakteryjnego DNA z zapewnieniem wymaganej ilości odczytów (pokrycie min. 50x) • sekwencjonowanie trzeciej generacji NGS przygotowanych preparatów dla wybranych prób bakteryjnego DNA • wykonanie analizy bioinformatycznej i przekazanie danych Zamawiającemu wraz z raportem końcowym. • w trakcie wykonywania usługi bieżące informowanie Zamawiającego o postępach prac nad zleconymi próbkami i ew. problemach, np. w zakresie jakości przesłanych próbek DNA, poprzez kontakt mailowy. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zawiera SWZ oraz Załącznik nr 1 (Opis przedmiotu zamówienia), Załącznik nr 2 (Projektowane postanowienia umowy), Załącznik nr 5 (Formularz cenowy)
Pokaż więcej
Adres pocztowy: ul. Chełmska 30/34
Kod pocztowy: 00-725
Miejscowość: Warszawa
Kraj: Polska 🇵🇱
Miejsce wykonania: Miasto Warszawa 🏙️
Czas trwania: 12 miesięcy
Kryteria przyznawania nagród
Cena
Cena (waga): 60
Kryterium jakości (nazwa): Jakość 40 % W ramach kryterium "ocena techniczna" oferta może uzyskać max. 40 pkt. Ocena będzie dokonywana wg następujących zasad: Przygotowanie bibliotek DNA na potrzeby sekwencjonowania NGS wyłącznie metodą fragmentacji enzymatycznej - 20 pkt Przygotowanie bibliotek DNA na potrzeby sekwencjonowania NGS wyłącznie metodą fragmentacji mechanicznej - 40 pkt Uwaga: brak wskazania w ofercie parametrów podlegających ocenie (tj. metody fragmentacji) będzie niezgodne z SWZ i spowoduje odrzucenie oferty na podstawie art. 226 ust 1. pkt 5 ustawy Pzp.
Kryterium jakości (waga): 40
Tytuł
Numer identyfikacyjny działki: LOT-0001

Procedura
Rodzaj procedury
Procedura otwarta
Podstawa prawna: Dyrektywa 2014/24/UE
Główne aspekty procedury:
1. W prowadzonym postępowaniu, w oparciu o art. 139 ust. 1 ustawy Pzp, Zamawiający najpierw dokona badania i oceny ofert, a następnie dokona kwalifikacji podmiotowej Wykonawcy, którego oferta została najwyżej oceniona, w zakresie braku podstaw wykluczenia oraz spełniania warunków udziału w postępowaniu. 2. Zamawiający wykluczy z postępowania wykonawców, wobec których zachodzą podstawy wykluczenia, o których mowa w art. 108 ust. 1 z zastrzeżeniem art 110 ust. 2 ustawy Pzp. 3. Zamawiający wykluczy Wykonawców, wobec których zachodzą podstawy wykluczenia, o których mowa w art. 7 ust. 1 ustawy z dnia 13 kwietnia 2022 r. o szczególnych rozwiązaniach w zakresie przeciwdziałania wspieraniu agresji na Ukrainę oraz służących ochronie bezpieczeństwa narodowego (t.j. Dz.U. z 2024 r. poz. 507) oraz w art. 5k rozporządzenia Rady (UE) 833/2014 z dnia 31 lipca 2014 r. dotyczącego środków ograniczających w związku z działaniami Rosji destabilizującymi sytuację na Ukrainie (Dz. Urz. UE.L Nr 229, str. 1 z późniejszymi zmianami) - wzór oświadczenia stanowi Załącznik nr 9 do SWZ. 4. Wykonawca zobowiązany jest złożyć ofertę zgodnie z Formularzem ofertowym, stanowiącym Załącznik nr 3 do SWZ i Formularzem cenowym, stanowiącym załącznik nr 5 do SWZ. 5. Wraz z ofertą Wykonawca zobowiązany jest złożyć oświadczenie, o którym mowa w art. 125 ust. 1 ustawy Pzp (JEDZ/ESPD), którego wzór stanowi załącznik nr 4 do SWZ, w zakresie wskazanym w SWZ. Wykonawca składa oświadczenie na formularzu JEDZ. JEDZ stanowi dowód potwierdzający brak podstaw wykluczenia oraz spełnianie warunków udziału w postępowaniu, na dzień składania ofert oraz stanowi dowód tymczasowo zastępujący wymagane przez zamawiającego podmiotowe środki dowodowe, wskazane w SWZ. Serwis umożliwiający wypełnienie i ponowne wykorzystanie „jednolitego dokumentu” dostępny jest pod adresem: https://espd.uzp.gov.pl. 6. Wykaz podmiotowych środków dowodowych na potwierdzenie spełniania warunków udziału w postępowaniu oraz braku podstaw wykluczenia określony został w Rozdziale VIII SWZ. 7. Zamawiający, stosownie do art. 95 ust. 1 ustawy Pzp wymaga zatrudnienia przez Wykonawcę lub podwykonawcę na podstawie stosunku pracy osób wykonujących czynności w zakresie realizacji zamówienia, których wykonanie polega na wykonywaniu pracy w sposób określony w art. 22 § 1 ustawy z dnia 26 czerwca 1974 r. - Kodeks pracy (t.j. Dz. U. z 2023 r. poz. 1465 ze zm.). Zamawiający wymaga zatrudnienia na umowę o pracę osób bezpośrednio wykonujących czynności związane z usługą sekwencjonowania. 8. Zamawiający nie wymaga zatrudnienia osób, o których mowa w art. 96 ust. 2 pkt 2 ustawy Pzp. 9. Zamawiający nie wymaga złożenia przedmiotowych środków dowodowych. 10. Zamawiający nie wymaga wniesienia wadium. 11. Postępowanie prowadzone jest w języku polskim. 12. Wykonawca powinien zapoznać się ze specyfikacją warunków zamówienia, zwaną dalej „SWZ”. 13. Komunikacja zamawiającego z wykonawcami odbywa się przy użyciu środków komunikacji elektronicznej, przy użyciu platformy zakupowej „eZamawiający” firmy Otwarty Rynek Elektroniczny S.A. – Marketplanet, ul. Domaniewska 49, 02-672 Warszawa, zwanej dalej „Platformą”, dostępną pod adresem: https://nil.ezamawiajacy.pl. 14. We wszelkiej korespondencji związanej z niniejszym postępowaniem zamawiający i wykonawcy posługują się nr sprawy 20/NIL/ZZ-SP/24 15. Szczegółowa instrukcja korzystania z Platformy dostępna jest pod ww. adresem https://nil.ezamawiajacy.pl w zakładce „Baza Wiedzy”. Problemy w obsłudze Platformy należy zgłaszać na adres: ezamawiajacy_zgloszenia@marketplanet.pl lub pod nr tel. + 48 22 257 22 23.
Pokaż więcej
Informacje administracyjne
Termin składania ofert lub wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu: 2024-11-28 10:00:00 📅
Warunki otwarcia ofert: 2024-11-28 10:30:00 📅
Warunki otwarcia ofert (Informacje o osobach upoważnionych i procedurze otwarcia): otwarcie na platformie zakupowej „eZamawiający”
Języki, w których można składać oferty lub wnioski o dopuszczenie do udziału w postępowaniu: polski 🗣️
Minimalne ramy czasowe, w których oferent musi utrzymać ofertę: 90 dni
Warunki przetargu
Wymagane jest użycie zaawansowanego lub kwalifikowanego podpisu elektronicznego lub pieczęci elektronicznej (zgodnie z definicją w rozporządzeniu (UE) nr 910/2014)
Data otwarcia: 2024-11-28 10:30:00 📅
Informacje dodatkowe: otwarcie na platformie zakupowej „eZamawiający”
Fakturowanie elektroniczne: Dozwolone
Stosowana będzie płatność elektroniczna
Kryteria przyznawania nagród
Rodzaj wagi: Waga (wartość punktowa, dokładna)
Warunki przetargu
Umowa zawiera warunki realizacji

Informacje prawne, ekonomiczne, finansowe i techniczne
Warunki uczestnictwa
Kryterium kwalifikacji: Odpowiednie kwalifikacje edukacyjne i zawodowe
Wykaz i krótki opis zasad i kryteriów:
Zamawiający wymaga aby Wykonawca dla potwierdzenia umiejętności wykonania analiz sekwencjonowania technologiami NGS oraz składania bakteryjnych struktur genomowych złożył kopie co najmniej 3 publikacji takich analiz z okresu ostatnich 3 lat, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy – w tym okresie.
Pokaż więcej
O udzielenie zamówienia mogą ubiegać się wykonawcy, którzy spełniają warunki udziału w postępowaniu dotyczące zdolności technicznej lub zawodowej: Zamawiający wymaga, aby Wykonawca złożył aktualny nie starszy niż dwuletni certyfikat jakości EMQN (European Molecular Quality Network), dokumentujący ocenę jakości sekwencjonowania NGS.
Pokaż więcej
Zamawiający wymaga, aby Wykonawca wykazał się zrealizowaniem co najmniej jednej usługi, przedmiotem której jest sekwencjonowanie genomów bakteryjnych, o wartości nie niższej niż 200.000,00 zł brutto w okresie ostatnich 3 latach lub jeśli okres prowadzenia działalności jest krótszy w tym okresie, wraz z podaniem wartości usług, przedmiotu, daty realizacji i podmiotów, na rzecz których usługi zostały wykonane oraz załączył dowody potwierdzające, że usługi zostały wykonane należycie, przy czym dowodami są referencje bądź inne dokumenty wystawione przez podmiot, na rzecz którego usługi były wykonane, a jeżeli z uzasadnionej przyczyny o obiektywnym charakterze Wykonawca nie jest w stanie uzyskać tych dokumentów - oświadczenie Wykonawcy.
Pokaż więcej
Warunki związane z umową
Warunki realizacji zamówienia:
1. Zamawiający wymaga zawarcia umowy w sprawie zamówienia publicznego na warunkach określonych w Projektowanych postanowieniach umowy, stanowiących Załącznik nr 2 do SWZ. 2. Przyjmuje się, że zapisy do Projektowanych postanowień umowy nie zakwestionowane przed złożeniem oferty zostaną przyjęte przez Wykonawcę bez zastrzeżeń w chwili jej podpisania. 3. Zamawiający, stosownie do art. 95 ust. 1 ustawy Pzp wymaga zatrudnienia przez Wykonawcę lub podwykonawcę na podstawie stosunku pracy osób wykonujących czynności w zakresie realizacji zamówienia, których wykonanie polega na wykonywaniu pracy w sposób określony w art. 22 § 1 ustawy z dnia 26 czerwca 1974 r. - Kodeks pracy (t.j. Dz. U. z 2023 r. poz. 1465). Zamawiający wymaga zatrudnienia na umowę o pracę osób bezpośrednio wykonujących czynności związane z usługą sekwencjonowania.
Pokaż więcej
Warunki uczestnictwa
Podstawa wykluczenia:
Bezpośrednie lub pośrednie zaangażowanie w przygotowanie przedmiotowego postępowania o udzielenie zamówienia
Korupcja
Nadużycia
+ jeszcze 9
Naruszenie obowiązku opłacenia składek na ubezpieczenie społeczne
Naruszenie obowiązku płatności podatków
Naruszenie obowiązków określonych w podstawach wykluczenia o charakterze wyłącznie krajowym
Naruszenie obowiązków w dziedzinie prawa pracy
Porozumienia z innymi wykonawcami mające na celu zakłócenie konkurencji
Praca dzieci i inne formy handlu ludźmi
Pranie pieniędzy lub finansowanie terroryzmu
Przestępstwa terrorystyczne lub przestępstwa związane z działalnością terrorystyczną
Udział w organizacji przestępczej
Opis przesłanek wykluczenia:
Dotyczy art. 108 ust 1 pkt 6 ustawy Pzp
Dotyczy art. 108 ust 1 pkt 1 i 2 ustawy Pzp
Dotyczy art. 108 ust 1 pkt 1 lit. h i pkt. 2 ustawy Pzp
Dotyczy art. 108 ust 1 pkt 3 ustawy Pzp
Dotyczy art. 108 ust 1 pkt 1 i art. 108 ust 1 pkt 4 ustawy Pzp. Art.7 ust. 1 ustawy z dnia 13 kwietnia 2022 r. o szczególnych rozwiązaniach w zakresie przeciwdziałania wspieraniu agresji na Ukrainę oraz służących ochronie bezpieczeństwa narodowego (t.j. Dz.U. z 2024 r. poz. 507)
Pokaż więcej
Dotyczy art. 108 ust 1 pkt 5 ustawy Pzp

Instytucja zamawiająca
Nazwa i adresy
Nazwa: Narodowy Instytut Leków
Krajowy numer rejestracyjny: NIP 5213212384
Adres pocztowy: ul. Chełmska 30/34
Kod pocztowy: 00-725
Miasto pocztowe: Warszawa
Region: Miasto Warszawa 🏙️
Kraj: Polska 🇵🇱
Punkt kontaktowy: Dział Zamówień Publicznych i Zaopatrzenia
E-mail: b.lipinska@nil.gov.pl 📧
Telefon: +48 223311557 📞
URL: www.nil.gov.pl 🌏
Adres na potrzeby wymiany informacji (URL): https://nil.ezamawiajacy.pl 🌏
Rodzaj instytucji zamawiającej
Podmiot prawa publicznego
Główna działalność
Zdrowie
Komunikacja
Dokumenty URL: https://nil.ezamawiajacy.pl 🌏
Adres URL uczestnictwa: https://nil.ezamawiajacy.pl 🌏
Zgłoszenie elektroniczne: Wymagane

Informacje uzupełniające
Organ kontrolny
Nazwa: Krajowa Izba Odwoławcza
Krajowy numer rejestracyjny: NIP 5262239325
Adres pocztowy: ul. Postępu 17A
Kod pocztowy: 02-676
Miasto pocztowe: Warszawa
Region: Miasto Warszawa 🏙️
Kraj: Polska 🇵🇱
E-mail: odwolania@uzp.gov.pl 📧
Telefon: +48 224587801 📞
URL: https://www.gov.pl/web/uzp/krajowa-izba-odwolawcza 🌏
Adres na potrzeby wymiany informacji (URL): https://epuap.gov.pl/wps/portal/strefa-klienta/katalog-spraw/opis-uslugi/odwolanie-do-krajowej-izby-odwolawczej/UZP 🌏
Służba, od której można uzyskać informacje o procedurze odwoławczej
Tak samo jak: Organ kontrolny
Procedura przeglądu
Dokładne informacje na temat terminu (terminów) procedur odwoławczych:
Odwołanie wnosi się do Prezesa Izby w formie pisemnej w postaci papierowej albo w postaci elektronicznej, opatrzone odpowiednio własnoręcznym podpisem albo kwalifikowanym podpisem elektronicznym, w terminie 10 dni od dnia przekazania informacji o czynności zamawiającego stanowiącej podstawę jego wniesienia, jeżeli informacja została przekazana przy użyciu środków komunikacji elektronicznej, albo 15 dni, jeżeli informacja została przekazana w sposób inny niż określony powyżej. Odwołanie wobec treści ogłoszenia wszczynającego postępowanie o udzielenie zamówienia lub konkurs lub wobec treści dokumentów zamówienia wnosi się w terminie 10 dni od dnia zamieszczenia ogłoszenia w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej lub dokumentów zamówienia na stronie internetowej. Środki ochrony prawnej przysługują Wykonawcom, a także innym podmiotom, jeżeli mają lub miały interes w uzyskaniu zamówienia oraz poniosły lub mogą ponieść szkodę w wyniku naruszenia przez Zamawiającego przepisów ustawy Pzp. Szczegółowe informacje dotyczące środków ochrony prawnej określone są w Dziale IX „Środki ochrony prawnej” ustawy Pzp.
Pokaż więcej
Informacje o elektronicznych przepływach pracy
Akceptowane będzie fakturowanie elektroniczne
Źródło: OJS 2024/S 208-646398 (2024-10-23)
Ogłoszenie o udzieleniu zamówienia (2025-01-07)
Obiekt
Zakres zamówienia
Całkowita wartość zamówienia (bez VAT): 2897461.8 PLN 💰
Opis
Wartość szacunkowa bez VAT: 2 355 660 PLN 💰

Udzielenie zamówienia
Udzielono zamówienia/części zamówienia
Numer identyfikacyjny działki: LOT-0001
Numer umowy: 36/NIL/ZZ-UM/24
Data zawarcia umowy: 2024-12-11 📅
Tytuł: Umowa na usługę sekwencjonowania NGS
Informacje o przetargach
Liczba ofert otrzymanych drogą elektroniczną: 1
Informacja o wartości zamówienia/działki (bez VAT)
Całkowita wartość umowy/działki: 2897461.8 PLN 💰
Identyfikator oferty: Oferta Genomed S.A.
Identyfikator części zamówienia lub grupy części: LOT-0001
Informacje o przetargach
Nazwa strony oferującej: Wykonawca Genomed S.A.
Nazwa i adres wykonawcy
Nazwa: Genomed S.A.
Krajowy numer rejestracyjny: NIP 7010083563
Adres pocztowy: ul. Ponczowa 12
Kod pocztowy: 02-971
Miasto pocztowe: Warszawa
Region: Miasto Warszawa 🏙️
Kraj: Polska 🇵🇱
E-mail: info@genomed.pl 📧
Telefon: +48 226446019 📞
URL: www.genomed.pl 🌏
Źródło: OJS 2025/S 005-010045 (2025-01-07)