Usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing)

Narodowy Instytut Leków

1. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek
2. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA:
• całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore)
• stężenie w próbce >100 ng/ul
• czystość (A260/A280) ≥ 1.8

Termin

Termin składania ofert wynosił 2023-05-09. Zamówienie zostało opublikowane na stronie 2023-03-31.

Dostawcy

Następujący dostawcy są wymienieni w decyzjach o przyznaniu zamówienia lub innych dokumentach dotyczących zamówień:

• Genomed S.A.

Kto?

• Narodowy Instytut Leków

Co?

• Usługi badawcze › Laboratoryjne usługi badawcze

Gdzie?

• Warszawski stołeczny › Miasto Warszawa

Historia zamówień

Data	Dokument
2023-03-31	Ogłoszenie o zamówieniu
2023-04-05	Dodatkowe informacje
2023-06-28	Ogłoszenie o udzieleniu zamówienia

Ogłoszenie o zamówieniu (2023-03-31)
Obiekt
Zakres zamówienia
Tytuł: Laboratoryjne usługi badawcze
Numer referencyjny: 5/NIL/ZZ-SP/23
Krótki opis:

1. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek 2. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA: • całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore) • stężenie w próbce >100 ng/ul • czystość (A260/A280) ≥ 1.8

Metadane ogłoszenia
Język oryginału: polski 🗣️
Typ dokumentu: Ogłoszenie o zamówieniu
Rodzaj zamówienia: Usługi
Regulacja: Unia Europejska
Wspólny słownik zamówień (CPV)
Kod: Laboratoryjne usługi badawcze 📦
Miejsce wykonania
Region NUTS: Polska 🏙️

Procedura
Typ procedury: Procedura otwarta
Typ oferty: Wniosek dotyczący wszystkich partii
Kryteria przyznawania nagród
Oferta najbardziej korzystna ekonomicznie

Instytucja zamawiająca
Tożsamość
Kraj: Polska 🇵🇱
Typ instytucji zamawiającej: Inne
Nazwa instytucji zamawiającej: Narodowy Instytut Leków
Adres pocztowy: ul. Chełmska 30/34
Kod pocztowy: 00-725
Miasto pocztowe: Warszawa
Kontakt
Adres internetowy: http://www.nil.gov.pl 🌏
E-mail: b.lipinska@nil.gov.pl 📧
Telefon: +48 223311557 📞
Fax: +48 223311558 📠
URL dokumentów: https://nil.ezamawiajacy.pl 🌏

Odniesienie
Daty
Data wysłania: 2023-03-31 📅
Termin składania ofert: 2023-05-09 📅
Data publikacji: 2023-04-05 📅
Identyfikatory
Numer ogłoszenia: 2023/S 068-203619
Numer Dz.U.-S: 68
Informacje dodatkowe

W prowadzonym postępowaniu, w oparciu o art. 139 ust. 1 ustawy Prawo zamówień publicznych (t.j. Dz.U. z 2022 r., poz. 1710 z póź. zm.), Zamawiający najpierw dokona badania i oceny ofert, a następnie dokona kwalifikacji podmiotowej Wykonawcy, którego oferta została najwyżej oceniona, w zakresie braku podstaw wykluczenia oraz spełniania warunków udziału w postępowaniu.

Obiekt
Zakres zamówienia
Krótki opis:

1. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek

2. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA:

• całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore)

• stężenie w próbce >100 ng/ul

• czystość (A260/A280) ≥ 1.8

1. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach).

2. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek

3. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA:

4. Przedmiotem niniejszej usługi jest :

• Sekwencjonowanie NGS DNA genomu bakteryjnego o…

… wielkości 2-3 mln par zasad z użyciem platformy Illumina MiSeq; odczyty sparowane o długości 300 zasad; pokrycie 50x; adapter & quality trimming oraz składanie genomów

… wielkości 5-6 mln par zasad z użyciem platformy Illumina MiSeq; odczyty sparowane o długości 300 zasad; pokrycie 50x; adapter & quality trimming oraz składanie genomów

… wielkości 2-6 mln par zasad z użyciem platformy Nanopore Minion; pokrycie 50x; adapter & quality trimming oraz składanie genomów z wynikami Miseq.

Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia został zawarty w załączniku nr 1 do SWZ.
Czas trwania: 12 miesięcy
Informacje dodatkowe:

Miejsce wykonania
Główne miejsce lub miejsce wykonywania działalności: Narodowy Instytut Leków, ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa

Informacje prawne, ekonomiczne, finansowe i techniczne
Warunki uczestnictwa
Zdolność do prowadzenia działalności zawodowej: Zamawiający nie określa szczegółowych warunków w tym zakresie
Sytuacja gospodarcza i finansowa: Zamawiający nie określa szczegółowych warunków w tym zakresie
Zdolności techniczne i zawodowe:

1) Zamawiający wymaga aby Wykonawca dla potwierdzenia umiejętności wykonania analiz sekwencjonowania technologiami NGS oraz składania bakteryjnych struktur genomowych złożył kopie co najmniej 2 publikacji takich analiz z okresu ostatnich 3 lat, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy – w tym okresie.

2) Zamawiający wymaga, aby Wykonawca złożył aktualny certyfikat jakości EMQN (European Molecular Quality Network), dokumentujący ocenę jakości sekwencjonowania NGS.

3) Zamawiający wymaga, aby Wykonawca wykazał się zrealizowaniem co najmniej jednej usługi, przedmiotem której jest sekwencjonowanie genomów bakteryjnych, o wartości nie niższej niż 200.000,00 zł brutto w okresie ostatnich 3 latach lub jeśli okres prowadzenia działalności jest krótszy w tym okresie, wraz z podaniem wartości usług, przedmiotu, daty realizacji i podmiotów, na rzecz których usługi zostały wykonane oraz załączył dowody potwierdzające, że usługi zostały wykonane należycie, przy czym dowodami są referencje bądź inne dokumenty wystawione przez podmiot, na rzecz którego usługi były wykonane, a jeżeli z uzasadnionej przyczyny o obiektywnym charakterze Wykonawca nie jest w stanie uzyskać tych dokumentów - oświadczenie Wykonawcy

Realizacja zamówienia
Warunki realizacji zamówienia:

1. Zamawiający wymaga zawarcia umowy na warunkach określonych w "Projektowanych postanowieniach umowy", stanowiących załącznik nr 2 do SWZ.

2. Zmiana postanowień niniejszej umowy może nastąpić w formie pisemnego aneksu pod rygorem nieważności

w przypadku:

a) wystąpienia zdarzeń siły wyższej, jako zdarzenia zewnętrznie niemożliwego do przewidzenia i niemożliwego do zapobieżenia, które będą miały wpływ na sposób, częstotliwość świadczenia usług oraz wynagrodzenie, termin wykonania przedmiotu umowy i będą powodowały konieczność zmian w tym zakresie,

b) wystąpienia zmiany powszechnie obowiązujących przepisów prawa, w zakresie mającym istotny wpływ na realizację przedmiotu Umowy.

3. Przyjmuje się, że zapisy do Projektowanych postanowień umowy nie zakwestionowane przed złożeniem oferty zostaną przyjęte przez Wykonawcę bez zastrzeżeń w chwili jej podpisania. Wszelkie pytania i wątpliwości dotyczące Projektowanych postanowień umowy, będą rozpatrywane jak dla całej SWZ.

Procedura
Podstawa prawna: 32014L0024
Czas składania ofert: 10:00
Języki, w których można składać oferty lub wnioski o dopuszczenie do udziału w postępowaniu: polski 🗣️
Okres ważności oferty: 2023-08-04 📅
Data otwarcia ofert: 2023-05-09 📅
Czas otwarcia ofert: 10:30
Miejsce: NARODOWY INSTYTUT LEKÓW, ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa
Zgodnie z zapisami rozdziału XVII SWZ.
Kryteria przyznawania nagród
Kryterium jakości (nazwa): metoda fragmentacji
Kryterium jakości (waga): 40
Cena (waga): 60

Instytucja zamawiająca
Tożsamość
Inny rodzaj instytucji zamawiającej: instytut badawczy
Kontakt
Punkt kontaktowy: Barbara Lipińska
Adres internetowy: www.nil.gov.pl 🌏
Dokumenty URL: https://nil.ezamawiajacy.pl 🌏

Odniesienie
Informacje dodatkowe

1. Komunikacja między Zamawiającym a Wykonawcami w niniejszym postępowaniu odbywać się będzie przy użyciu środków komunikacji elektronicznej, tj. platforma (Marketplanet): https://nil.ezamawiajacy.pl.

2. We wszelkiej korespondencji związanej z niniejszym postępowaniem zamawiający i wykonawcy posługują się nr sprawy 5/NIL/ZZ-SP/23.

3. Wykonawca przystępując do niniejszego postępowania o udzielenie zamówienia akceptuje warunki korzystania z w/w platformy i obowiązujących Regulaminów dostępnych na stronie https://oneplace.marketplanet.pl/regulamin

4. Wymagania techniczne i organizacyjne sporządzenia, wysyłania i odbierania korespondencji elektronicznej opisane zostały w instrukcji dla wykonawcy dostępnej na platformie pod linkiem: https://nil.ezamawiajacy.pl/servlet/HomeServlet?MP_module=main&MP_action=publicFilesList& clientName

5. Wykonawca jako podmiot profesjonalny ma obowiązek sprawdzania komunikatów i wiadomości bezpośrednio na platformie Marketplanet: https://nil.ezamawiajacy.pl przesłanych przez Zamawiającego, gdyż system powiadomień może ulec awarii lub powiadomienie może trafić do folderu SPAM.

6. Zamawiający nie wymaga wniesienia wadium, ani zabezpieczenia umowy.

Informacje uzupełniające
Organ kontrolny
Nazwa: Krajowa Izba Odwoławcza
Adres pocztowy: ul. Postępu 17a
Miasto pocztowe: Warszawa
Kod pocztowy: 02-676
Kraj: Polska 🇵🇱
Telefon: +48 224587801 📞
E-mail: odwolania@uzp.gov.pl 📧
Fax: +48 224587800 📠
Adres internetowy: www.uzp.gov.pl 🌏
Informacje o terminach składania odwołań:

Środki ochrony prawnej przysługują Wykonawcy, a także innemu podmiotowi, jeżeli ma lub miał interes w uzyskaniu danego zamówienia oraz poniósł lub może ponieść szkodę w wyniku naruszenia przez Zamawiającego przepisów ustawy Prawo zamówień publicznych – w trybie i na zasadach przepisów działu IX ustawy Pzp (Dz.U. z 2022 r., poz. 1710 z póź. zm.)

Służba, od której można uzyskać informacje o procedurze odwoławczej
Tak samo jak: Organ kontrolny
Źródło: OJS 2023/S 068-203619 (2023-03-31)

Dodatkowe informacje (2023-04-05)
Obiekt
Metadane ogłoszenia
Typ dokumentu: Dodatkowe informacje

Odniesienie
Daty
Data wysłania: 2023-04-05 📅
Data publikacji: 2023-04-07 📅
Identyfikatory
Numer ogłoszenia: 2023/S 070-211327
Odnosi się do ogłoszenia: 2023/S 068-203619
Numer Dz.U.-S: 70
Informacje dodatkowe

Ponadto Zamawiający informuje: • niniejsze postępowanie prowadzone jest w trybie przetargu nieograniczonego na podstawie art. 132 ustawy z dnia 11 września 2019 r. Prawo Zamówień Publicznych, dalej ustawa Pzp. (Dz.U. z 2022 r. poz. 1710 ze zm.), aktów wykonawczych do ustawy; • o udzielenie zamówienia mogą ubiegać się wykonawcy, którzy nie podlegają wykluczeniu na podstawie art. 108 ust. 1 ustawy Pzp, z zastrzeżeniem art. 110 ust. 2 ustawy Pzp; • z postępowania o udzielenie zamówienia Zamawiający wykluczy wykonawcę, w stosunku do którego zachodzą okoliczności wskazane w art. 7 ust. 1 ustawy z dnia 13 kwietnia 2022 r. o szczególnych rozwiązaniach w zakresie przeciwdziałania wspieraniu agresji na Ukrainę oraz służących ochronie bezpieczeństwa narodowego (t.j. Dz. U. z 2023 r. poz. 129 ze zm.) oraz w art. 5k rozporządzenia Rady (UE) 833/2014 z dnia 31 lipca 2014 r. dotyczącego środków ograniczających w związku z działaniami Rosji destabilizującymi sytuację na Ukrainie (Dz.Urz.UE.L Nr 229, str. 1), zmienionym rozporządzeniem Rady (UE) 2022/576 z dnia 8 kwietnia 2022 r. w sprawie zmiany rozporządzenia (UE) nr 833/2014 dotyczącego środków ograniczających w związku z działaniami Rosji destabilizującymi sytuację na Ukrainie (Dz. Urz. UE nr L 111, str. 1); • szczegółowe informacje na temat oświadczeń i dokumentów składanych przez Wykonawców znajdują się w SWZ; • ofertę należy złożyć za pośrednictwem platformy https://nil.ezamawiajacy.pl; • stosownie do art. 95 ust. 1 ustawy Pzp Zamawiający wymaga zatrudnienia przez Wykonawcę lub podwykonawcę na podstawie stosunku pracy osób wykonujących czynności w zakresie realizacji zamówienia, których wykonanie polega na wykonywaniu pracy w sposób określony w art. 22 § 1 ustawy z dnia 26 czerwca 1974 r. - Kodeks pracy (t.j. Dz. U. z 2022 r. poz. 1510 ze zm.). Zamawiający wymaga zatrudnienia na umowę o pracę osób bezpośrednio wykonujących czynności związane z usługą sekwencjonowania.

Informacje dodatkowe

Ponadto Zamawiający informuje:

• niniejsze postępowanie prowadzone jest w trybie przetargu nieograniczonego na podstawie art. 132 ustawy z dnia 11 września 2019 r. Prawo Zamówień Publicznych, dalej ustawa Pzp. (Dz.U. z 2022 r. poz. 1710 ze zm.), aktów wykonawczych do ustawy;

• o udzielenie zamówienia mogą ubiegać się wykonawcy, którzy nie podlegają wykluczeniu na podstawie art. 108 ust. 1 ustawy Pzp, z zastrzeżeniem art. 110 ust. 2 ustawy Pzp;

• z postępowania o udzielenie zamówienia Zamawiający wykluczy wykonawcę, w stosunku do którego zachodzą okoliczności wskazane w art. 7 ust. 1 ustawy z dnia 13 kwietnia 2022 r. o szczególnych rozwiązaniach w zakresie przeciwdziałania wspieraniu agresji na Ukrainę oraz służących ochronie bezpieczeństwa narodowego (t.j. Dz. U. z 2023 r. poz. 129 ze zm.) oraz w art. 5k rozporządzenia Rady (UE) 833/2014 z dnia 31 lipca 2014 r. dotyczącego środków ograniczających w związku z działaniami Rosji destabilizującymi sytuację na Ukrainie (Dz.Urz.UE.L Nr 229, str. 1), zmienionym rozporządzeniem Rady (UE) 2022/576 z dnia 8 kwietnia 2022 r. w sprawie zmiany rozporządzenia (UE) nr 833/2014 dotyczącego środków ograniczających w związku z działaniami Rosji destabilizującymi sytuację na Ukrainie (Dz. Urz. UE nr L 111, str. 1);

• szczegółowe informacje na temat oświadczeń i dokumentów składanych przez Wykonawców znajdują się w SWZ;

• ofertę należy złożyć za pośrednictwem platformy https://nil.ezamawiajacy.pl;

• stosownie do art. 95 ust. 1 ustawy Pzp Zamawiający wymaga zatrudnienia przez Wykonawcę lub podwykonawcę na podstawie stosunku pracy osób wykonujących czynności w zakresie realizacji zamówienia, których wykonanie polega na wykonywaniu pracy w sposób określony w art. 22 § 1 ustawy z dnia 26 czerwca 1974 r. - Kodeks pracy (t.j. Dz. U. z 2022 r. poz. 1510 ze zm.). Zamawiający wymaga zatrudnienia na umowę o pracę osób bezpośrednio wykonujących czynności związane z usługą sekwencjonowania.

Źródło: OJS 2023/S 070-211327 (2023-04-05)

Ogłoszenie o udzieleniu zamówienia (2023-06-28)
Obiekt
Zakres zamówienia
Krótki opis:

Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA: • całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore) • stężenie w próbce >100 ng/ul • czystość (A260/A280) ≥ 1.8

Całkowita wartość zamówienia: 981973.55 PLN 💰
Metadane ogłoszenia
Typ dokumentu: Ogłoszenie o udzieleniu zamówienia
Miejsce wykonania
Region NUTS: Miasto Warszawa 🏙️

Procedura
Typ oferty: Nie dotyczy

Odniesienie
Daty
Data wysłania: 2023-06-28 📅
Data publikacji: 2023-07-03 📅
Identyfikatory
Numer ogłoszenia: 2023/S 125-397422
Numer Dz.U.-S: 125

Obiekt
Zakres zamówienia
Krótki opis:

Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek

Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA:

1.. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach).

3. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego.

Parametry DNA:

Sekwencjonowanie NGS DNA genomu bakteryjnego o…

… wielkości 2-3 mln par zasad - 325 prób

… wielkości 5-6 mln par zasad - 880 prób

… wielkości 2-6 mln par zasad - 70 prób

Miejsce wykonania
Główne miejsce lub miejsce wykonywania działalności: Warszawa, mazowieckie , Polska

Udzielenie zamówienia
Data zawarcia umowy: 2023-06-07 📅
Nazwa: Genomed S.A.
Miasto pocztowe: Warszawa
Kod pocztowy: 02-971
Kraj: Polska 🇵🇱
Całkowita wartość zamówienia: 964959.60 PLN 💰
Informacje o przetargach
Liczba otrzymanych ofert: 1
Źródło: OJS 2023/S 125-397422 (2023-06-28)

Nowe zamówienia w powiązanych kategoriach 🆕

Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe oraz pokrewne usługi doradcze (>20 nowe zamówienia)

Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe (14)

Usługi badawcze (10)