Opis zamówienia
Sekwenator nowej generacji (1 szt.)
Lp. Parametry wymagane - minimalne
1. Wysokoprzepustowy sekwenator DNA do masowego równoległego sekwencjonowania DNA w konfiguracji umożliwiającej:
1.1 Analizę bibliotek poprzez masowe równoległe sekwencjonowanie bez stosowania emulsyjnego PCR w trybie pojedynczego odczytu oraz sparowanych końców
1.2 Analizę gotowych i zaprojektowanych paneli genowych z możliwością wykorzystania co najmniej 10 Gb (10 miliardów par zasad) przepustowości
Uwaga! Kryterium oceny ofert
1.3 Sekwencjonowanie de novo w trybie sparowanych końców
1.4 Sekwencjonowanie de novo i resekwencjonowanie bibliotek DNA przygotowanych bez stosowania mechanicznej fragmentacji DNA
2. Metoda sekwencjonowania:
2.1 Sekwencjonowanie poprzez syntezę
2.2 W pełni zautomatyzowane cykle amplifikacji i sekwencjonowania, sekwencjonowanie w trybie sparowanych końców nie wymagające fizycznej zmiany orientacji komórki przepływowej
3. Zakres zastosowania urządzenia:
3.1 Analiza metagenomiczna
3.2 Sekwencjonowanie de novo małych genomów (mikroorganizmów)
3.3 Resekwencjonowanie całego genomu mikroorganizmów
3.4 Sekwencjonowanie amplikonów
4. Zakres wykorzystania wyników resekwencjonowania
4.1 Mapowanie danych na referencyjnym genomie
4.2 Wyszukiwanie wariancji liczby kopii genu
4.3 Wyszukiwanie inwersji, mutacji punktowych, delecji
4.4 Importowanie danych z systemu do programów do analizy i wizualizacji danych
5. Długość odczytu
5.1 Zmienna z możliwością dostosowania jej do wybranej aplikacji
5.2 W zakresie od 36 do 2x <250 par zasad
6. Ilość materiału wejściowego
6.1 W zakresie od 1 do 50 ng
7. Możliwość łączenia wielu próbek w jednej reakcji sekwencjonowania
7.1 Mieszanie próbek dzięki zastosowaniu etykiet multipleksujących (barkodów) w ilości minimum 48
8. Jakość odczytu
8.1 Na poziomie Q30 (maksymalnie 1 błąd na 1000 par zasad) dla co najmniej 70 % odczytów
9. Pozostałe wymagane cechy
9.1 Posiadanie zintegrowanych modułów do amplifikacji, odczytu sekwencji oraz analizy danych
9.2 Zautomatyzowana, niewymagająca ingerencji użytkownika aparatu, izotermiczna amplifikacja na fazie stałej (komórka przepływowa), prowadząca do wytworzenia macierzy klastrów
10. Komputer sterujący
10.1 Zintegrowany
10.2 Kompletny, dedykowany i zoptymalizowany do obsługi analizatora
10.3 Z wbudowanym ekranem dotykowym
10.4 Z zainstalowanym systemem operacyjnym i oprogramowaniem analizatora, co najmniej 16 GB RAM, co najmniej 750 GB HDD
11. Oprogramowanie do analizy uzyskanych wyników
11.1 Dostępne funkcje – co najmniej: base calling, alignment, variant calling
11.2 W języku polskim lub angielskim
11.3 Licencja dożywotnia
12. Wielkość i zasilanie urządzenia
12.1 Urządzenie nastołowe
12.2 Nie wymaga podłączenia do wody, próżni, gazów technicznych ani medycznych
12.3 230V, 50Hz
13. Instalacja i serwis
13.1 Aparat instalowany i serwisowany przez autoryzowanego przedstawiciela producenta
13.2 Gwarancja co najmniej 12 miesięcy od daty podpisania protokołu odbioru bez zastrzeżeń
Uwaga! Kryterium oceny ofert
13.3 Czas reakcji serwisu w przypadku awarii:
• do 5 dni roboczych – odpowiedź mailowa lub telefoniczna z uwzględnieniem zdalnej diagnozy
• do 30 dni – czas naprawy urządzenia
13.4 Zestaw instalacyjny wraz z procedurą walidacyjną
13.5 Zestaw instalacyjny niezbędny do przeprowadzenia reakcji testowej
14. UPS
14.1 UPS umożliwiający podłączenie wysokoprzepustowego sekwenatora DNA do masowego równoległego sekwencjonowania DNA (sekwenatora nowej generacji)
14.2 Moc: 865W
14.3 Gniazda wyjściowe: 10x IEC320 C13
14.4 Czas przełączania 10 ms
14.5 Czas podtrzymania zasilania systemu do sekwencjonowania (średni) - 10 min
14.6 Typ: Wolnostojący
14.7 Sygnalizacja dźwiękowa stanów alarmowych
15. Dostarczone dokumenty
15.1 Deklaracja zgodności CE
15.2 Instrukcja obsługi w języku polskim i angielskim
UWAGA!!! Ze względu na niemożność umieszczenia, wynikającą z przyczyn technicznych, cd opisu przedmiotu zamówienia od pkt. 16 zamieszczono w VI.3 "Informacje dodatkowe"