Dostawa odczynników do badań na sekwenatorze DNA firmy Illumina na potrzeby Katedry i Zakładu Genetyki Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu

Krótki opis

Przedmiotem zamówienia jest: Dostawa odczynników do badań na sekwenatorze DNA firmy Illumina na potrzeby Katedry i Zakładu Genetyki Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu.
Dostawa 2 zestawów odczynników TruSight Oncology 500 wraz dostępem do oprogramowania dedykowanego do analizy danych onkologicznych w panelu NGS dla Katedry i Zakładu Genetyki UMW.

Opis zamówienia

1. Przedmiotem zamówienia jest: Dostawa odczynników do badań na sekwenatorze DNA firmy Illumina na potrzeby Katedry i Zakładu Genetyki Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu. Dostawa 2 zestawów odczynników TruSight Oncology 500 wraz dostępem do oprogramowania dedykowanego do analizy danych onkologicznych w panelu NGS dla Katedry i Zakładu Genetyki UMW.
2. Opis przedmiotu zamówienia:
TruSight Oncology 500 jest testem do analizy molekularnej komórek nowotworów, o najszerszym obecnie, jednoczasowo badanym spektrum zmian molekularnych w komórkach nowotworu. Materiał genetyczny do badań za pomocą TruSight™ Oncology 500 jest izolowany z bloczków parafinowych. Na tym materiale można przeprowadzić sekwencjonowanie 523 genów, identyfikację wariantów pojedynczych nukleotydów (SNVs), insercji i delecji w genomie, ocenę zmienności liczby kopii (CNVs), ocenę wariantów wielonukleotydowych, a także ocenę niestabilności mutacyjnej i mikrosatelitarnej oraz wariantów fuzyjnych i splicingowych RNA. Zestawy odczynników są adresowane do badań na sekwenatorze DNA firmy Ilumina. Jest to koniecznym wymogiem, gdyż badania w ramach realizowanego projektu będą prowadzone na sekwenatorze DNA, firmy Ilumina.
Wraz z zestawem odczynników Wykonawca dostarcza adekwatną do liczny badanych prób licencję oprogramowania kompatybilnego z powstałymi bibliotekami, pozwalającego na przeprowadzenie analizy trzeciorzędowej zakończonej przygotowaniem raportu z analizy wskazującego istotne klinicznie zmiany genetyczne. Wykonawca zobowiązany jest zapewniać dostęp oprogramowania przez okres maksymalnie 12 miesięcy od daty dostawy odczynników. System „Pierian Dx CGW for Illumina, interpretation report” zawiera oprogramowanie, opracowane do analizy i raportowania uzyskanych danych.
Zamówienie uwzględnia utworzenie konta użytkownika oprogramowania dedykowanego do analizy danych onkologicznego panelu NGS obejmującego co najmniej 500 genów i przeznaczonego do jednoczesnego oznaczania zmian genetycznych na poziomie DNA i RNA oraz obliczania współczynników TMB oraz MSI oraz wdrożenie oprogramowania w laboratorium użytkownika. Proces wdrożenia obejmuje: uzgodnienie i ustanowienie połączenia sieciowego i metod przesyłania danych, utworzenie kont administracyjnych dla użytkownika, uzgodnienie i przygotowanie standardowego szablonu raportowania danych uwzględniającego preferencje użytkownika oraz zakresu parametrów konfigurowalnych przez klienta przy tworzeniu raportów z kolejnych prób analizowanych przy pomocy w/w panelu NGS. Proces wdrożenia zakończony testem akceptacji Zamawiającego.
Planowane badania maja potencjalnie duże, międzynarodowe znaczenie dla rozwoju postępowania personalizowanego w onkologii, opartego na znajomości zmian genetycznych w komórkach nowotworu. W związku z tym konieczne jest, aby były przeprowadzone z wykorzystaniem odczynników, programów do analizy wyników i na sprzęcie, wykorzystywanych powszechnie w krajach Unii Europejskiej, UK i USA, gdyż umożliwia to powtórzenie eksperymentu przez innych badaczy i dzięki temu międzynarodowe uznanie wyników za wiarygodne i mogące stać się podstawą do wprowadzenia nowych markerów molekularnych do postepowania personalizowanego w onkologii.
3. Przedmiot zamówienia, określony w opisie przedmiotu zamówienia z pkt. 2 powyżej, wymaga bezwzględnego stosowania odczynników tych samych producentów. Podane przy odczynnikach w opisie przedmiotu zamówienia nazwy tych odczynników określają wymagany przez Zamawiającego standard, który jest niezbędny do kontynuacji badań i konieczności porównywania wyników oznaczeń.

Informacje dodatkowe

Zamawiający ustalił termin realizacji przedmiotu zamówienia:
dostawa odczynników do 4 tygodni od dnia podpisania umowy oraz dostęp do oprogramowania przez okres maksymalnie 12 miesięcy od daty dostawy ostatniej partii odczynników.

1. Zamawiający przed wyborem najkorzystniejszej oferty wezwie Wykonawcę, którego oferta została najwyżej oceniona, do złożenia w wyznaczonym terminie, nie krótszym niż 10 dni:
1) Oświadczenia o niepodleganiu wykluczeniu oraz spełnianiu warunków udziału w postępowaniu, w zakresie wskazanym przez Zamawiającego, składanego na formularzu jednolitego europejskiego dokumentu zamówienia, sporządzonym zgodnie ze wzorem standardowego formularza określonego w rozporządzeniu wykonawczym Komisji (UE) 2016/7 z dnia 5 stycznia 2016 r. ustanawiającym standardowy formularz jednolitego europejskiego dokumentu zamówienia (Dz. Urz. UE L 3 z 06.01.2016, str. 16), zwanego dalej „JEDZ”; wzór JEDZ będzie stanowić załącznik do wezwania;
2) Informacji z Krajowego Rejestru Karnego w zakresie art. 108 ust. 1 pkt 1 i 2 Pzp oraz art. 108 ust. 1 pkt 4 Pzp dotyczącej orzeczenia zakazu ubiegania się o zamówienie publiczne tytułem środka karnego, sporządzonej nie wcześniej niż 6 miesięcy przed jej złożeniem, aktualnej na dzień złożenia;
3) Aktualnego na dzień złożenia, oświadczenia Wykonawcy, w zakresie art. 108 ust. 1 pkt 5 Pzp, o braku przynależności do tej samej grupy kapitałowej w rozumieniu ustawy z dnia 16 lutego 2007 r. o ochronie konkurencji i konsumentów (Dz. U. z 2021 r. poz. 275), z innym Wykonawcą, który złożył odrębną ofertę, albo oświadczenia o przynależności do tej samej grupy kapitałowej wraz z dokumentami lub informacjami potwierdzającymi przygotowanie oferty, niezależnie od innego Wykonawcy należącego do tej samej grupy kapitałowej; wzór oświadczenia będzie stanowić załącznik do wezwania,
4) Oświadczenia Wykonawcy o aktualności informacji zawartych w oświadczeniu, o którym mowa w ppkt. 1 oraz o aktualności informacji dotyczących podstaw wykluczenia z postępowania, o których mowa w art. 5k rozporządzenia 833/2014, w brzmieniu nadanym rozporządzeniem 2022/576, oraz na podstawie art. 7 ust.1 ustawy w zakresie przeciwdziałania wspieraniu agresji na Ukrainę; wzór oświadczenia będzie stanowić załącznik do wezwania.
2. Wzory oświadczeń, o których mowa w pkt. 1, zostaną przesłane Wykonawcy wraz z wezwaniem, o którym mowa w pkt. 1.
3. Jeżeli Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania poza granicami Rzeczypospolitej Polskiej, zamiast dokumentu, o którym mowa w ppkt. 1.2, składa informację z odpowiedniego rejestru, takiego jak rejestr sądowy, albo w przypadku braku takiego rejestru, inny równoważny dokument wydany przez właściwy organ sądowy lub administracyjny kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, w zakresie, o którym mowa w ppkt. 1.2.
4. Dokument, o którym mowa w pkt. 3, powinien być wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed jego złożeniem.
5. Jeżeli w kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, nie wydaje się dokumentów, o których mowa w pkt. 3, lub gdy dokumenty te nie odnoszą się do wszystkich przypadków, o których mowa w ppkt. 1.2, zastępuje się je odpowiednio w całości lub w części dokumentem zawierającym odpowiednio oświadczenie Wykonawcy, ze wskazaniem osoby albo osób uprawnionych do jego reprezentacji, lub oświadczenie osoby, której dokument miał dotyczyć, złożone pod przysięgą, lub, jeżeli w kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania nie ma przepisów o oświadczeniu pod przysięgą, złożone przed organem sądowym lub administracyjnym, notariuszem, organem samorządu zawodowego lub gospodarczego, właściwym ze względu na siedzibę lub miejsce zamieszkania Wykonawcy. Zapisy pkt. 4 stosuje się.
6. Zamawiający, zgodnie z art. 139 Pzp, zastrzega, że może najpierw dokonać badania i oceny ofert, a następnie dokonać kwalifikacji podmiotowej Wykonawcy, którego oferta została najwyżej oceniona, w zakresie braku podstaw wykluczenia oraz spełniania warunków udziału w postępowaniu.
7. Zamawiający nie żąda wniesienia wadium.
8. Zamawiający nie żąda wniesienia zabezpieczenia należytego wykonania umowy przez Wykonawcę.

Dokładne informacje na temat terminu (terminów) procedur odwoławczych

1. Środki ochrony prawnej przysługują Wykonawcy oraz innemu podmiotowi, jeżeli ma lub miał interes w uzyskaniu zamówienia oraz poniósł lub może ponieść szkodę w wyniku naruszenia przez Zamawiającego przepisów Pzp.
2. Środki ochrony prawnej wobec ogłoszenia wszczynającego postępowanie o udzielenie zamówienia oraz dokumentów zamówienia, przysługują również organizacjom wpisanym na listę organizacji uprawnionych do wnoszenia środków ochrony prawnej, prowadzoną przez Prezesa Urzędu Zamówień Publicznych oraz Rzecznikowi Małych i Średnich Przedsiębiorców
3. Terminy wnoszenia odwołania:
1) Odwołanie wnosi się w terminie 10 dni od dnia przekazania informacji o czynności Zamawiającego stanowiącej podstawę jego wniesienia, jeżeli informacja została przekazana przy użyciu środków komunikacji elektronicznej lub 15 dni od dnia przekazania informacji o czynności Zamawiającego stanowiącej podstawę jego wniesienia, jeżeli informacja została przekazana w inny sposób;
2) Odwołanie wobec treści ogłoszenia wszczynającego postępowanie o udzielenie zamówienia lub wobec treści dokumentów zamówienia, wnosi się w terminie 10 dni od dnia publikacji ogłoszenia w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej lub zamieszczenia dokumentów zamówienia na stronie internetowej;
3) Odwołanie w przypadkach innych niż określone w ppkt. 1 i 2 wnosi się w terminie 10 dni od dnia, w którym powzięto lub przy zachowaniu należytej staranności można było powziąć wiadomość o okolicznościach stanowiących podstawę jego wniesienia.
4) Jeżeli Zamawiający mimo takiego obowiązku nie przesłał Wykonawcy zawiadomienia
o wyborze najkorzystniejszej oferty, odwołanie wnosi się w terminie:
a) 30 dni od dnia publikacji w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej ogłoszenia o udzieleniu zamówienia,
b) 6 miesięcy od dnia zawarcia umowy, jeżeli Zamawiający nie opublikował w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej ogłoszenia o udzieleniu zamówienia.
4. Terminy oblicza się według przepisów prawa cywilnego. Jeżeli koniec terminu do wykonania czynności przypada na dzień uznany ustawowo za wolny od pracy lub na sobotę, termin upływa następnego dnia, który nie jest dniem wolnym od pracy ani sobotą.
5. Odwołanie przysługuje na:
1) niezgodną z przepisami ustawy czynność Zamawiającego, podjętą w postępowaniu o udzielenie zamówienia, w tym na projektowane postanowienie umowy;
2) zaniechanie czynności w postępowaniu o udzielenie zamówienia, do której Zamawiający był obowiązany na podstawie ustawy;
3) zaniechanie przeprowadzenia postępowania o udzielenie zamówienia na podstawie ustawy, mimo że Zamawiający był do tego obowiązany.
6. Odwołanie wnosi się do Prezesa Krajowej Izby Odwoławczej.
7. Odwołujący przekazuje Zamawiającemu odwołanie wniesione w formie elektronicznej albo postaci elektronicznej albo kopię tego odwołania, jeżeli zostało ono wniesione w formie pisemnej, przed upływem terminu do wniesienia odwołania w taki sposób, aby mógł on zapoznać się z jego treścią przed upływem tego terminu.
8. Pisma w postępowaniu odwoławczym wnosi się w formie pisemnej albo w formie elektronicznej albo w postaci elektronicznej, z tym, że odwołanie i przystąpienie do postępowania odwoławczego, wniesione w postaci elektronicznej, wymagają opatrzenia podpisem zaufanym.
9. Pisma w formie pisemnej wnosi się za pośrednictwem operatora pocztowego, w rozumieniu ustawy z dnia 23 listopada 2012 r. - Prawo pocztowe, osobiście, za pośrednictwem posłańca, a pisma w postaci elektronicznej wnosi się przy użyciu środków komunikacji elektronicznej, w tym na adres do doręczeń elektronicznych, o którym mowa w art. 2 pkt 1 ustawy z dnia 18. 11. 2020 r. o doręczeniach elektronicznych (tekst jedn. - Dz. U. z 2022 r., poz. 569).
10. Szczegółowe informacje dotyczące środków ochrony prawnej określone są w Dziale IX „Środki ochrony prawnej” Pzp.